Suite aux négociations tendues entre Almerys et la Fédération des syndicats pharmaceutiques de France (FSPF) concernant les coûts liés à la télétransmission, soit 0,05 euros par facture, la plateforme avait assigné le syndicat devant le tribunal de grande instance (TGI) de Paris. Elle se considérait ainsi victime de "messages inexacts et tendancieux portant une atteinte grave à son image".

Almerys a été déboutée en référé le 16 mars selon le Quotidien du Pharmacien. La plateforme a été condamnée à verser la somme de 2000 euros à la Fédération des syndicats pharmaceutiques de France (FSPF) au titre de l'article 700 du code de la procédure civile. 

Pour Almerys, « il ne s’agit pas d’une amende, mais d’un différend civil avec la Fédération des syndicats pharmaceutiques de France. Le tribunal de grande instance a estimé qu’il n’y avait pas lieu à référer, ne jugeant pas le différend sur le fond ».